赤潮造成的危害有，海水污染以及鱼类大量死亡。赤潮后期，赤潮生物大量死亡，在细菌分解作用下，会造成环境严重缺氧或者产生硫化氢等有害物质，使海洋生物缺氧或中毒死亡，有些赤潮的体内或代谢产物中含有生物毒素，能直接毒死鱼、虾、贝类等生物。
赤潮
赤潮，又称红潮，国际上也称其为有害藻类或红色幽灵，是在特定的环境条件下，海水中某些浮游植物、原生动物或细菌爆发性增殖或高度聚集而引起水体变色的一种有害生态现象。
赤潮并不都是红色的，不同的浮游生物引起海水不同的颜色，赤潮只是各种颜色潮的总称，过于丰富的营养元素导致藻类生物的大量繁殖而引起缺氧，是产生赤潮的主要原因。
赤潮是一种复杂的生态异常现象，发生的原因也比较复杂，关于赤潮成因尚没有定论，科学家们认为，赤潮是近岸海水受到有机物污染所致。
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